Tỷ lệ sử dụng để chiết khấu dòng tiền trong tương lai với giá trị hiện tại là một biến quan trọng của quá trình này.

Chi phí vốn bình quân gia quyền (sau thuế) của một công ty thường được sử dụng, nhưng nhiều người tin rằng nó là thích hợp để sử dụng tỉ lệ chiết khấu cao hơn để điều chỉnh cho rủi ro hoặc các yếu tố khác. Một tỷ lệ chiết khấu biến với tỷ lệ cao hơn áp dụng để rút tiền chảy xảy ra dọc theo khoảng thời gian có thể được sử dụng để phản ánh các đường cong lãi suất phí bảo hiểm cho món nợ dài hạn.

Một cách tiếp cận để lựa chọn các yếu tố tỷ lệ chiết khấu là để quyết định mức vốn cần thiết cho dự án có thể trở lại nếu đầu tư vào một liên doanh khác. Nếu, ví dụ, vốn cần thiết cho dự án có thể kiếm được năm phần trăm ở những nơi khác, sử dụng tỷ lệ chiết khấu trong tính toán NPV cho phép một so sánh trực tiếp được thực hiện giữa Dự án A và thay thế. Liên quan đến khái niệm này là sử dụng Tỷ lệ tái đầu tư của công ty. Tỷ lệ tái đầu tư có thể được định nghĩa là tỷ lệ lợi nhuận đầu tư của công ty trên trung bình. Khi phân tích các dự án trong một môi trường vốn hạn chế, nó có thể thích hợp để sử dụng tỷ lệ tái đầu tư chứ không phải là chi phí bình quân của công ty vốn là yếu tố giảm giá. Nó phản ánh chi phí cơ hội đầu tư, chứ không phải là chi phí có thể thấp hơn vốn.

Một NPV tính bằng cách sử dụng các tỉ lệ chiết khấu biến (nếu họ được biết đến trong thời gian đầu tư) tốt hơn phản ánh tình hình thực tế hơn một tính từ tỷ lệ chiết khấu liên tục cho toàn bộ thời hạn đầu tư. Hãy tham khảo bài viết hướng dẫn bằng văn bản của Samuel Baker [3] để có mối quan hệ chi tiết giữa giá trị NPV và tỷ lệ chiết khấu.

Đối với một số nhà đầu tư chuyên nghiệp, các quỹ đầu tư cam kết để nhắm mục tiêu một tỷ lệ hoàn vốn nhất định. Trong trường hợp này, đó là tỷ lệ lợi nhuận nên được lựa chọn là tỷ lệ chiết khấu để tính NPV. Bằng cách này, một so sánh trực tiếp có thể được thực hiện giữa lợi nhuận của dự án và tỷ lệ hoàn vốn mong muốn.

Trong một chừng mực nào đó, việc lựa chọn tỷ lệ chiết khấu là phụ thuộc vào việc sử dụng mà nó sẽ được đưa. Nếu mục đích chỉ đơn giản là để xác định liệu một dự án sẽ tăng thêm giá trị cho công ty, sử dụng chi phí vốn bình quân của công ty có thể thích hợp. Nếu cố gắng để quyết định giữa các khoản đầu tư thay thế để tối đa hóa giá trị của công ty, tỷ lệ tái đầu tư của công ty có thể sẽ là một lựa chọn tốt hơn.

Bằng cách sử dụng tỷ lệ thay đổi theo thời gian, hoặc chiết khấu các dòng tiền "được đảm bảo" phân biệt với các dòng tiền "nguy hiểm" có thể là một phương pháp cao cấp hơn, nhưng hiếm khi được sử dụng trong thực tế. Việc sử dụng tỷ lệ chiết khấu để điều chỉnh cho nguy cơ thường là rất khó để làm trong thực tế (đặc biệt là quốc tế), và là khó khăn để làm tốt. Một thay thế cho sử dụng yếu tố chiết khấu để điều chỉnh rủi ro là làm chính xác một cách rõ ràng dòng tiền mặt cho các yếu tố nguy cơ bằng cách sử dụng rNPV hoặc một phương pháp tương tự, sau đó chiết khấu theo tỷ lệ của công ty.